Inizia nel cinema nel 1973 come assistente alla regia e scenografo per Alain Tanner, Claude Goretta e altri. Nel 1978 ha realizzato con Gérard Mortillat il lungo documentario ‘La voix de son maitre’, ma bisogna aspettare gli anni Novanta perché il lavoro di Philibert venga notato e apprezzato dalla critica. Nel 1989 ha girato ‘La ville Louvre’, mentre ‘Nel paese dei sordi’ (1992) impone il regista come uno dei più originali del nuovo cinema francese. Successivamente ha diretto ‘Un animal, des animaux’ (1994), ‘Le moindre des choses’ (1996), ‘Qui sait?’ (1998). Nel 2002 ha presentato ‘Essere e avere’, fenomeno di incassi in Francia e vincitore del Festival "France Cinema" di Firenze.